Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC153Q494R4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms