Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL40Q2TBA0 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL40Q2TBA0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms