Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC27Q2M243 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC27Q2M243 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms