Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ODF2-213ENST00000448249 2059 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Q1T7F1 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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