Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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COL24A1Q17RW2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COL24A1Q17RW2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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