Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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HIF1AQ16665 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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HIF1AQ16665 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HIF1AQ16665 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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