Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECM1Q16610 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECM1Q16610 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms