Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TAF11Q15544 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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TAF11Q15544 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF11Q15544 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms