Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHBQ15464 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SHBQ15464 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHBQ15464 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHBQ15464 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms