Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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SYCP1Q15431 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SYCP1Q15431 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYCP1Q15431 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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