Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB35Q15286 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RAB35Q15286 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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