Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
EEA1Q15075 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms