Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
POLD3Q15054 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms