Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R3HDM1Q15032 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
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