Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CHD4Q14839 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CHD4Q14839 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CHD4Q14839 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CHD4Q14839 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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CHD4Q14839 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CHD4Q14839 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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