Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SEMA3AQ14563 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms