Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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COL9A3Q14050 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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COL9A3Q14050 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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COL9A3Q14050 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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COL9A3Q14050 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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COL9A3Q14050 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
COL9A3Q14050 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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