Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK13Q14004 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK13Q14004 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
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