Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DDX39BQ13838 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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