Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTMR3Q13615 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MTMR3Q13615 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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