Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNW1Q13573 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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