Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TUBB3Q13509 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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