Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDE3BQ13370 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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