Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTPRSQ13332 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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PTPRSQ13332 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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PTPRSQ13332 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTPRSQ13332 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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