Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ACACAQ13085 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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