Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM32Q13049 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms