Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BNIP3Q12983 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BNIP3Q12983 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
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