Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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FOXC1Q12948 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
FOXC1Q12948 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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