Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PTPRJQ12913 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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PTPRJQ12913 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPRJQ12913 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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