Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
COX10Q12887 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COX10Q12887 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COX10Q12887 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COX10Q12887 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms