Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPAL4Q0D2K0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms