Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
LRP1Q07954 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms