Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RUNX1T1Q06455 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms