Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CACNG1Q06432 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms