Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EXOSC9Q06265 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EXOSC9Q06265 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms