Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHRNEQ04844 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms