Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPCQ03188 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms