Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
DSG1Q02413 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DSG1Q02413 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms