Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
XPCQ01831 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
XPCQ01831 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
XPCQ01831 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms