Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IRX1P78414 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IRX1P78414 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms