Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAE1P78406 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RAE1P78406 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms