Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-21P61565 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-21P61565 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms