Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCBP4P57723 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCBP4P57723 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms