Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A2P55011 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A2P55011 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms