Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGDP52209 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGDP52209 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PGDP52209 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms