Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCR5P51681 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCR5P51681 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCR5P51681 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCR5P51681 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCR5P51681 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms