Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
RAB9AP51151 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms