Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
USP8P40818 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
USP8P40818 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP8P40818 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP8P40818 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP8P40818 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms