Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
FDFT1P37268 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms