Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NUP214P35658 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms